轰轰烈烈的第二次雅金杜维攻防战，最终在天道驾驶楚心高达，单枪匹马摧毁弥赛亚要塞中落下了帷幕。
基神（基拉）的老婆拉克丝克莱茵成为了PLANT的新任最高议长。基神（基拉）陪伴左右，形影不离。
阿斯兰的老婆卡嘉莉继续担任奥布的首席执行官。阿斯兰陪伴左右，形影不离。
穆拉弗拉格带着老婆玛琉拉米亚斯一起来到奥布隐居。
命运高达的驾驶员真飞鸟和脉冲高达的驾驶员露娜玛利亚霍克有情人终成眷属。
迪亚哥终于得偿所愿，在两年后和米丽雅莉亚哈乌有情人终成眷属。婚后，迪亚哥离开扎夫特军队，陪着妻子米丽雅莉亚哈乌一起周游世界，继续拍摄地球各地的美丽风景。
一直暗恋玛琉拉米亚斯的永恒号舰长安德鲁巴尔特菲尔德，最后和同样一直暗恋阿斯兰的美玲霍克（露娜玛利亚霍克的妹妹）走到了一起。在暗恋这方面，两个人无疑有着共同的话题。两个人婚后也来到了奥布定居，一个人遥望玛琉拉米亚斯，一个人遥望阿斯兰。
智慧女神号的舰长塔丽亚库拉迪斯辞去了舰长的职务，从此离开扎夫特军队，回到家里安心相夫教子，不再过问时事。
高达SEED的世界虽然经历了两次雅金杜维攻防战，但是战争爆发的因素依然存在。只要有野心家存在，战争就永远不会停止。
传说高达的驾驶员雷扎巴雷尔，在第二次雅金杜维攻防战结束以后，下落不明。有传闻说雷扎巴雷尔正在秘密组建一支实力恐怖的地下势力，想要继承劳鲁克鲁泽和吉尔伯特迪兰达尔未完成的梦想，杀死所有人类，摧毁这个世界。
作为第二次雅金杜维攻防战的最大功臣，天道回到了地球生活。
在这个美女如云、却都名花有主的世界里，天道无疑是非常悲催的。
每天陪伴在天道身边的，只有几只整天吵得要死的哈罗。
和平年代，最容易让人遗忘的就是那些曾经在战斗中拼死作战的英雄。天道等人的存在，很快就被和平的人们所遗忘。
天道没有闲着，每天开始疯狂学习，像一块海绵一样吸收着这个世界的各种知识。
因为天道的特殊地位，所以被卡嘉莉特别安排在奥布的核心地带居住。一座独栋的大别墅，别墅内的住宿条件更是好到不可思议。
不过其中蕴含的监视意味不言而喻。毕竟像天道这样的“大杀器”，绝对不能够放任其流浪在外，否则很多人晚上会睡不踏实。尤其是在第二次雅金杜维攻防战结束以后，楚心高达在战场上神秘失踪，更是加深了众人心中的忧虑。
因为天道无法使用魄一，所以就不能自由离开高达SEED的世界。天道甚至已经做好了在这个世界孤独终老的准备。
命运总是会跟天道开玩笑。
几个月后的一天，高达SEED世界的头号通缉战犯雷扎巴雷尔独自潜入了天道居住的别墅里。
“雷扎巴雷尔？你好大的胆子啊！居然敢潜入我家里。”
“天道，我今天来没有恶意。”
“哼！谁知道呢！”
“天道，你过得应该很不开心吧？”
“我过得不开心？是谁告诉你的？我每天都过得很开心。”
“天道，我发现你身边连个可靠的人都没有。”
“呵呵！我不需要朋友。”
“天道，我愿意做你的朋友。”
“凭什么？就凭你是这个宇宙里的头号通缉战犯吗？”
“那只是他们对我的污蔑。自古成王败寇，如果是我赢了，我身上的耻辱自然会被洗刷干净。”
“我觉得你没有这个机会。”
“有！天道，只要你愿意帮助我。”
“帮助你发动战争？摧毁这个世界？”
“那只是一方面。”
“还有呢？”
“天道，我跟劳鲁克鲁泽一样，是克隆人。我体内的基因存在缺陷，老化速度非常快，需要定期食用抑制染色体变异胶囊来维持生命。”
“然后呢？”
“抑制染色体变异胶囊是由迪兰达尔议长发明的。”
“迪兰达尔议长已经被我杀死了。”
“我知道。天道，我调查过你，你是一个真正的天才。我想你肯定也能够开发出抑制染色体变异胶囊。如果我不食用抑制染色体变异胶囊，我的身体就会很快衰老直到死亡。”
“那真是可喜可贺啊！”
“可是天道，我不想死啊！我不惜冒险来找你，就是希望你能够为我开发出新的抑制染色体变异胶囊。”
“你凭什么觉得我会帮你？”
“天道，无论你需要什么，我都可以满足你。”
“很抱歉，雷，我想要的东西，你永远也满足不了我。”
“天道，不要把话说的这么绝对。只要是人，就一定会有弱点。”
“也许吧。”
“天道，求求你，帮我这一次吧！”
“抱歉。如果换做是其他人，我或许会帮这个忙，但是你肯定不行。”
“为什么？”
“因为你从来没有珍惜过其他人的生命。”
“珍惜其他人的生命？凭什么？我的存在，本来就是一个错误！”
“既然你的存在是一个错误，那你为什么还要努力的活着？为什么不直接去死？”
“天道，你！！！”
“雷，你走吧，我是永远不会帮助你的。”
“天道，有些忙，你不得不帮。”
“哦？我倒是很想知道你有什么底气说这种话。”
雷扎巴雷尔拿出了一张照片，照片里是整备班长科杰罗马德克一家三口。
天道见状，瞬间脸色大变，“你对他们下手了？”
“我只是很友好的请他们到我的秘密基地里做客，并没有伤害他们。当然，如果我出现了什么意外，我不保证我的手下们不会伤害他们。”
“呵呵！雷，虽然我不在乎他们的死活，但是我决定帮你开发抑制染色体变异胶囊。”
“天道，谢谢你。”
“雷，不必谢我。”
为了拯救整备班长科杰罗马德克一家人，天道被迫做出妥协。
“天道，你需要多长时间？”
“一个晚上足矣。”
雷扎巴雷尔闻言，脸上立刻写满了狐疑，“这不可能吧？”
“雷，你刚才不是说我是一个天才吗？天才的速度，你怎么可能理解？”
雷扎巴雷尔瞬间被天道怼的哑口无言。