奥多马雷，是从西方某个地区航海落难到东方的一批炼金师建立的岛屿。这座岛屿，看起来普普通通，其实整座岛屿都被炼金机关所包裹着。是名副其实的一座机关岛屿。
当初，暗夜魔王携带着他的幽灵军团试图从这里侵入到城都地区。而暗夜更是首先来到这里，为了获得制作蓬莱域最为关键材料的心之水滴，袭击了无限神奇宝贝拉帝亚斯和拉帝欧斯。
最后，人类炼金术士军团和传说神奇宝贝联盟，组成浩大的军团。就是在这附近，击溃了暗夜的军团，并将暗夜封印在了冥界深处。
故事中邪恶的怪物就是暗夜魔王，黑暗邪恶的力量便是他所带领的幽灵军团。而当时的大战也没有那么简单，可以说是死伤无数，惨烈至极。甚至奥多马雷岛屿本身，都受到了不可挽救的破坏。如果不是依靠炼金法阵和心之水滴的守护，这座岛屿，现在早就已经沉入海底了。
这一切都被之前那童话般的故事所掩盖了。而如今，小翔所要赶往的地方，就是前面故事的发生地——“水都”奥多马雷。
平时，小翔可以依靠雪儿的空间之门到达任何地方。但是这一次，却完全不行。无论奥多马雷，还是它旁边无限神奇宝贝制作的异空间附近，都不在正常的空间坐标上。并且，在那里，所有空间技能都会失效。包括瞬间移动、幽灵潜水之类的技能，也都没有办法使用。
所以，小翔这次不得不乘骑着喷火龙Y，亲自赶往奥多马雷。尽管这样的话，他很可能被火箭队给盯上。
阿波罗，雅典娜。这两位最擅长使用恶系神奇宝贝的火箭队干部，是首先赶来围堵小翔的人。
夜晚时分，小翔刚刚抵达奥多马雷，还来不及多看一眼奥多马雷的海上灯火。阿波罗和雅典娜就一左一右向着小翔这边逼来。
“火箭队吗。你们来得倒是很快……”小翔也不废话，首先放出火神虫和超级比雕。然后，他犹豫了一下，又放出了小洛奇亚。
阿波罗和雅典娜看到小翔竟然还有一只传说神奇宝贝，而且还是洛奇亚，都是忍不住心头一惊。不过，看到小翔的洛奇亚体型不够，并没有成熟，他们又松了口气。
“醒夜先生，虽然你有这么多的传说神奇宝贝。但是，我们火箭队并没有兴趣因为它们而得罪你。不过，你的那只超梦，是火箭队的财产。如果你愿意将其归还的话……”阿波罗看到小翔早有准备的样子，心里有点不安，首先开口道。
“呵呵，超梦是你们的财产吗？那么，你们是谁的财产？你们父母的，还是坂木的？说起来，我真的觉得你们很可怜，竟然要成为这个世界，首先面对我的恐怖的人。昔日，传说神奇宝贝组成联军，在这里迎战第一位魔君。今天，只有你们两个，却要迎战第二位魔君！”
小翔说完，身体渐渐被蓝色的铠甲所包裹住。与此同时，一阵阵波导风暴从小翔身体里涌出，吹得阿波罗和雅典娜睁不开眼睛。而小翔手臂上的“神之七情”也完全展开，显出螺旋之剑的模样。而同样展开的，还有小翔身体里，那仿佛火山爆发般的可怕气势。
“阿波罗，对手的实力太强。只有放出全部的神奇宝贝，拼命一搏才有机会！”雅典娜戴着的多功能眼镜似乎突然测量出了什么可怕的数据，赶紧对阿波罗提醒道。
“我知道了，雅典娜！”阿波罗听到后，赶紧一下子放出了所有的神奇宝贝：黑鲁加、大狼犬、酷豹、玛狃拉、乌鸦头头、狡猾天狗。清一色的恶系神奇宝贝。而雅典娜那边，则全部都是毒系神奇宝贝。看来，两人这次真的是有备而来。
“雅典娜吗？和我的辅助智能名字相同呢……战斗前，我有个问题想要问问你。你是怎么猜到，我的行踪的？”小翔没想到，火箭队的干部，也有叫雅典娜的。不过，人家都有阿波罗了，接下来会有雅典娜，也一点都不奇怪。
“分析过你的行踪之后，我发现你的行踪和武藏他们那三个家伙总有重叠的时候。所以，我们就一直跟在他们的身后，来到了奥多马雷……”雅典娜倒也没有想要掩盖的意思。
“原来是这样。你们的运气不错。那么，就让我们开始吧！绽开吧，美丽的火焰龙卷风！”
“全体神奇宝贝，恶波动！”
“全体神奇宝贝，猛毒素！”
三声命令几乎同时响起。然后，红色，蓝色，紫色，黑色，四种颜色的技能融合在一起，产生了意想不到的化学反应。巨大的爆炸，突然在奥多马雷的一个隐蔽的港口绽放。石板、道路、花木……小港口的一切瞬间全部都被摧毁。
而等到所有的一切恢复平静之后，只有一位身着残破铠甲的少年，仍然屹立在原地。虽然，也不是原地了，而是地面上的一个大坑之中。
“辛苦你们了，回去好好休息吧。”小翔看到同样濒死倒地的喷火龙、火神虫、超级比雕、小洛奇亚，有些怜惜地将它们全部收回到了蓬莱域中。
然后，小翔看向周围倒地不醒的阿波罗、雅典娜和他们的神奇宝贝们，皱起了眉头。
“小翔，他们交给我来处理如何？”突然间，一个意想不到的声音响起，吓了小翔一跳。然后，声音的主人也从树林中走了出来。
借着小道上昏暗的灯火，小翔看清了声音主人的身影。这让小翔瞪大眼睛，禁不住后退了两步。
“嘻嘻，好久不见啦，小翔。有没有想我呀？”金色的长发，红色的眼瞳，洋娃娃般的脸庞。还有黑色哥特式洋裙，黑白相间的小洋伞。
这个小女孩，是和三年前一点变化都没有的，赫尔莉斯。
“小赫尔……竟然在这里见到你，我难道是看到了幻觉吗？”小翔不敢置信。
“很遗憾，你没有看到幻觉，小少爷。”另一个熟悉的声音也跟着出现。然后，白色鬼从树林后面出现。同样跟在他身后从树林中出现的，还有雪妖女和水晶灯火灵。
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