在丹帝和小智的巅峰一战后，小智成为了世界最强，但他依然认为成为宝可梦大师的旅程仍未到终点。
和母亲还有大家告别后，小智打算打开门，通往新的旅程时，他才发现门外的不是熟悉的真新镇而是无尽的黑夜，说是黑夜也不尽然，因为在这漆黑的空间里，出现了他从所未见的画面。
成百上千的达克莱伊和克雷色利亚环绕着他，让他一时有些呆滞。“美梦神”和“噩梦神”？为什么会这么多？等等……难道我之前的一切都是梦境吗？他回头看去——“身后没有熟悉的妈妈和朋友，只有漆黑一片。”
“喂！新来的，地方到了，快点起来干活了。”一阵有些粗鲁的声音把小智惊醒，他睁开眼，面前是一个穿着白色制服的男人，在那纯白的上衣中有一个血红色的M让人印象深刻